Η ψυχοθεραπεία ψυχαναλυτικής κατεύθυνσης όπως και η Ψυχανάλυση, έχει ως στόχο μέσω της διερεύνησης του εαυτού και της καλύτερης γνώσης του, να αλλάξει σταδιακά τα στοιχεία και τις συμπεριφορές που δημιουργούν πρόβλημα στον άνθρωπο και τη ζωή του. Όπως σε κάθε μορφή ψυχοθεραπείας, έτσι κι εδώ ο απώτερος στόχος της θεραπείας είναι η προαγωγή της ψυχικής ευημερίας του ανθρώπου που αντιμετωπίζει ψυχολογικές δυσκολίες, είτε εξαιτίας ενός συγκεκριμένου προβλήματος είτε χωρίς να έχει ακόμη εντοπίσει τα βαθύτερα αίτια της συναισθηματικής του δυσκολίας.

Στην ψυχαναλυτικής κατεύθυνσης ψυχοθεραπεία, η θεραπευτική σχέση που δημιουργείται μέσα σε ένα πλαίσιο αμοιβαίας εμπιστοσύνης, αλληλοσεβασμού και ειλικρίνειας, είναι το όχημα μέσω του οποίου επιτυγχάνονται οι αλλαγές και η βελτίωση της ψυχικής κατάστασης του ανθρώπου. Γι’ αυτό είναι σημαντικό να υπάρξει μία ισχυρή «θεραπευτική συμμαχία», όπως λέγεται, μεταξύ του θεραπευόμενου και του θεραπευτή, η οποία θα στηρίξει την συνήθως μακρόπνοη και ίσως σε κάποιες φάσεις της δύσκολη πορεία της θεραπείας, στην οποία θεραπευτής και θεραπευόμενος είναι συνοδοιπόροι με κοινό προορισμό την ψυχική ευημερία του θεραπευόμενου.

Η ψυχαναλυτική ψυχοθεραπεία προσφέρει τη δυνατότητα να γνωρίσει κανείς καλύτερα τον εαυτό του, καθώς ανακαλύπτει με τη βοήθεια του θεραπευτή του πτυχές του εαυτού του που αν και μέχρι τώρα του ήταν άγνωστες, επηρέαζαν τον ίδιο και την ζωή του. Έτσι μαθαίνει να αντιμετωπίζει τα προβλήματα και τις δυσκολίες της ζωής με πιο αποτελεσματικό τρόπο, να αξιοποιεί τις δυνατότητές του και να δημιουργεί ισότιμες, ειλικρινείς και ισορροπημένες σχέσεις.